种业是农业的“芯片”，是国家经济安全、生态安全、社会安全的重要基础之一。肃州区有着得天独厚的光热水土资源和特殊的地理环境，是全球公认的最具优势的农作物制种区，被誉为“天然的种子加工厂”。全区种子产业形成了玉米、蔬菜、花卉、瓜类、牧草等多品种发展的现代种业格局，玉米种子和蔬菜种子生产量分别占全国种子总需求的10%和50%，蔬菜、花卉种子出口量占到全国蔬菜、花卉种子出口总量的一半以上，是全国最大的对外贸易制种基地和国家重要的良种繁育基地。
一是做大基地规模。全区制种面积多年稳定在30万亩左右，占到全区耕地面积的28.6%，其中：玉米制种15万亩、瓜菜制种10万亩、花卉制种3万亩、牧草制种2万亩，繁殖的农作物种子籽粒饱满、水分含量低、色泽正、产量高、品质优,是全国制种产业最集中的区域。
二是健全产业链条。全区从事种子生产加工的企业达到146家，种子研发、繁育、生产、加工、销售等关键环节日趋完善，初步形成了杂交玉米、蔬菜、花卉、草莓、牧草五大种业产业链条，制种品种超过5000个，年生产各类种子1亿公斤，年加工量达到2亿公斤。
三是做强研发能力。建成敦煌种业玉米研究院、田旺玉米研究所等7个现代制种技术创新、研发、示范、推广平台，穴盘育苗、节水灌溉、田间隔离生产、花粉冷冻储藏、病虫害综合防治等标准化生产技术得到广泛应用,培育形成了“敦煌飞天”“希望瑞丰”“蓝翔园艺”等知名种子品牌，全区拥有自主知识产权的品种达到260多个。
四是拓宽经济效益。目前，全区从事制种产业的农户达到5.6万户，占到农户总数的93%，户均制种收入达到2.2万元，农民人均纯收入中，来自制种产业的份额占到26%，现代种业已成为全区产业化程度最高、联系农户最广、农民收入比重最大、农业增收效益最为显著的支柱产业。
